PLATAFORMA DE INVESTIGACIÓN PRIORITARIA / BIOLOGÍA SINTÉTICA
PURELIX®
Exploramos vías biológicas hacia moléculas definidas.
La principal plataforma de biología sintética de YOHOLIFE® LAB, que conecta moléculas objetivo, sistemas enzimáticos e investigación en biofabricación.
De la complejidad molecular a la oportunidad de investigación.
Muchos compuestos naturales valiosos son estructuralmente complejos, están presentes en bajas concentraciones o son difíciles de separar de moléculas estrechamente relacionadas. Su desarrollo plantea un conjunto de preguntas interrelacionadas: ¿cómo puede formarse la estructura correcta, cómo puede demostrarse su identidad y cómo podría una vía prometedora convertirse en un proceso reproducible?
PURELIX® reúne esas preguntas en una sola plataforma de investigación. Nuestra cartera actual abarca glicósidos de Rhodiola, polifenoles, alcaloides, procianidinas y ginsenósidos. Exploramos rutas biosintéticas, transformaciones enzimáticas y sistemas de producción biológica, junto con la recuperación y la caracterización analítica, para generar evidencia que pueda orientar el desarrollo industrial futuro.
EL MARCO DE INVESTIGACIÓN
De una pregunta molecular
a una posibilidad puesta a prueba.
Nuestro marco conecta el diseño, la ingeniería biológica, el aprendizaje experimental y la evaluación de procesos. Abra cada área para explorar los métodos y la evidencia que pueden orientar un proyecto.
Los métodos se seleccionan en función de la molécula, el huésped y la pregunta de investigación. La biblioteca de investigación presenta las estructuras y la ciencia publicada que fundamentan nuestras preguntas de investigación.
01DISEÑODiseño de rutas metabólicasExplorar el enfoque
¿Cómo podría la biología ensamblar la molécula deseada?
- Mapeo de rutas
- Relacionar una estructura objetivo definida con reacciones de precursores, familias de enzimas y rutas biológicas publicadas.
- Evaluación de enzimas y cofactores
- Examinar la especificidad de las reacciones, las necesidades de cofactores y la compatibilidad de las etapas enzimáticas candidatas.
- Análisis de flujos y cuellos de botella
- Utilizar modelos metabólicos y perfiles de intermediarios medidos para explorar la competencia por los recursos celulares.
02CONSTRUCCIÓNStrain Engineering & Gene EditingExplorar el enfoque
¿Puede la ruta propuesta funcionar de forma coherente en un huésped biológico?
- Diseño del huésped y de la construcción génica
- Comparar huéspedes biológicos, arquitecturas de expresión génica y módulos de ruta en función de la pregunta objetivo.
- Edición genómica y ajuste de la expresión
- Explorar modificaciones genéticas dirigidas y el equilibrio de la expresión cuando se adecuen al organismo y al proyecto elegidos.
- Comprobaciones de identidad y estabilidad
- Vincular la verificación genética con los perfiles de compuestos y con observaciones de cultivo repetidas para examinar la constancia.
03TEST & LEARNHigh-Throughput Screening & AI OptimisationExplorar el enfoque
¿Qué siguiente experimento tiene más probabilidades de resolver una incertidumbre útil?
- Cribado en paralelo
- Comparar variantes o condiciones candidatas con controles adecuados y lecturas coherentes y medibles.
- Diseño de experimentos
- Estudiar las variables que interactúan y la repetibilidad, en lugar de interpretar una única observación prometedora.
- Priorización asistida por modelos
- Cuando la calidad de los datos lo permita, utilizar aprendizaje automático o aprendizaje activo para clasificar candidatos y cuantificar la incertidumbre.
04DESARROLLOFermentation Scale-Up & PurificationExplorar el enfoque
¿Cómo se comporta un resultado de laboratorio prometedor a medida que el proceso crece?
- Caracterización de la fermentación
- Examinar el comportamiento del cultivo, la transferencia de oxígeno, el mezclado y la estrategia de alimentación en relación con el compuesto definido.
- Cambio de escala
- Comparar las condiciones de ingeniería entre biorreactores y examinar cómo cambia el rendimiento biológico con la escala del proceso.
- Recuperación y purificación
- Comparar enfoques de separación a partir de la identidad del compuesto, los perfiles de impurezas y los balances de materia.
05VERIFICACIÓNAnalytics & Functional ValidationExplorar el enfoque
¿Qué es el material y qué puede establecer realmente la evidencia?
- Identidad y composición químicas
- Utilizar patrones de referencia adecuados y métodos complementarios de cromatografía, espectrometría de masas o análisis estructural.
- Prestaciones del método
- Examinar la especificidad, la precisión y la exactitud en la matriz de muestra prevista, con los controles adecuados.
- Función y contexto de la evidencia
- Seleccionar ensayos biológicos o pruebas de materiales pertinentes; interpretar de forma explícita la dosis, la forma química y las limitaciones del modelo.
Diseñar →︎ Construir →︎ Ensayar →︎ Aprender. La evidencia de cada área orienta la siguiente pregunta y puede llevarnos de vuelta a una decisión anterior.
CARTERA MOLECULAR DE PURELIX®
Una visión más detallada de nuestros intereses de investigación.
Explore identidades moleculares, características detalladas, fuentes biológicas e investigación publicada.
La biblioteca molecular ofrece un punto de partida para el intercambio científico y la colaboración, y está abierta a todo el mundo.
Damos la bienvenida a investigadores, inversores y posibles socios académicos o industriales que deseen conocer nuestra orientación científica o debatir ideas para una futura colaboración.
Explorar la biblioteca molecular →︎No se requiere cuenta.
EXPLORACIÓN ABIERTA
Más allá de la cartera actual.
Nuestras moléculas objetivo son un punto de partida. Explore a continuación las cuestiones técnicas más amplias y proponga otra posibilidad. Estos ejes son ideas de investigación, configuradas por la evidencia y la colaboración.
POSIBILIDADES DE INVESTIGACIÓNPURELIX®6 ejes de investigación · 24 ideas
01Pathway design & precursors
¿Qué configuración de la ruta podría formar el compuesto objetivo manteniendo comprensibles el suministro de precursores y las reacciones secundarias?
Comparación de vías
¿Qué etapas de la ruta y qué compuestos intermedios deberían compararse para la molécula objetivo seleccionada?
Disponibilidad de precursores
¿Dónde podría el suministro de precursores limitar la formación del compuesto y cómo podría ponerse a prueba esa limitación?
Bottlenecks & by-products
¿Qué patrones de intermediarios revelarían una etapa limitante o una reacción competidora no deseada?
Asignación de carbono
¿Cómo podría evaluarse la asignación de carbono entre el crecimiento, la ruta objetivo y las reacciones competidoras en condiciones de cultivo comparables?
02Enzymes & glycosylation
¿Cómo podrían la elección de la enzima y las condiciones de reacción favorecer la transformación química correcta en lugar de un producto relacionado?
Selectividad enzimática
¿Qué enzimas candidatas favorecen el sustrato y la transformación deseados en condiciones comparables?
Suministro de donadores de azúcar
En el caso de una molécula objetivo glicosilada, ¿cómo podrían la disponibilidad del donador y la especificidad del enlace glicosídico afectar al perfil del producto?
Activity & compatibility
¿Qué condiciones de reacción permiten que las enzimas de la ruta funcionen conjuntamente con una actividad y una estabilidad útiles?
Equilibrio enzimático
¿Cómo afectan las cantidades relativas de enzimas a la acumulación de intermediarios y al equilibrio entre los productos deseados y los relacionados?
03Host & process development
¿Cómo podría relacionarse el comportamiento de la ruta con un proceso de producción biológica controlado y reproducible?
Idoneidad del huésped
¿Qué características del huésped se ajustan a la ruta, al compuesto objetivo y al enfoque de recuperación previsto?
Condiciones de cultivo
¿Cómo afectan el pH, la temperatura y el aporte de nutrientes al crecimiento y al perfil de compuestos?
Repeatability & scale
¿Qué observaciones deben repetirse antes de que una vía justifique ensayos de proceso a mayor escala?
Tolerancia al producto
¿Cómo afectan el compuesto objetivo y los intermediarios clave al crecimiento del huésped y al comportamiento de la ruta a distintas concentraciones?
04Recovery & route assessment
¿Puede recuperarse, identificarse y evaluarse el compuesto deseado dentro de un proceso global viable?
Separation & recovery
¿Qué enfoques de separación recuperan la molécula objetivo limitando las pérdidas y los componentes no deseados?
Identity & composition
¿Qué patrones de referencia y mediciones complementarias distinguen la molécula objetivo de compuestos similares?
Comparación del proceso completo
¿Cómo se compararían la recuperación, los recursos utilizados y las limitaciones del proceso con las vías de abastecimiento o producción existentes?
Trazabilidad de impurezas
¿Qué etapas de la ruta o de la recuperación aportan compuestos no objetivo y cómo podría distinguirse su origen de una interferencia analítica?
05Biocatálisis acelular
¿Cómo podrían los sistemas enzimáticos fuera de células vivas respaldar transformaciones definidas y, al mismo tiempo, hacer medibles la compatibilidad de las reacciones y los requisitos de recursos?
Ensamblaje de cascadas enzimáticas
¿Qué secuencia de adición de enzimas o de módulos de reacción podría limitar las condiciones incompatibles preservando el perfil de producto deseado?
Reciclaje de cofactores
¿Cómo podrían las opciones de regeneración de cofactores afectar a la estabilidad de la reacción, a la formación del producto y a la cantidad de cofactor nuevo necesaria?
Organización espacial
¿Cómo cambia la organización de enzimas sobre un andamiaje la transferencia de intermediarios y el comportamiento de la reacción en comparación con enzimas libremente mezcladas?
Biocatalizadores reutilizables
¿Cómo podría la inmovilización afectar a la selectividad, la actividad y la recuperabilidad de las enzimas a lo largo de ciclos de reacción repetidos?
06Desarrollo guiado por datos
¿Cómo podrían los experimentos estructurados y los modelos orientar la siguiente decisión de desarrollo haciendo explícitos la incertidumbre y los límites de la predicción?
Conjuntos de datos comparables
¿Qué mediciones, comprobaciones de referencia y metadatos experimentales se necesitan para comparar de forma fiable rutas o procesos candidatos?
Diseño experimental
¿Qué combinaciones de condiciones podrían separar los efectos individuales de las interacciones manteniendo la reproducibilidad de la comparación?
Modelos predictivos
¿Qué modelos podrían priorizar rutas o procesos candidatos y cómo deberían contrastarse sus predicciones con nuevos experimentos?
Uncertainty & transferability
¿Cómo afectarían las lagunas de datos o un cambio de huésped, de molécula objetivo o de condiciones a la confianza en una recomendación guiada por modelos?
Son posibles puntos de partida para la exploración. Recibimos con interés otras ideas, preguntas de investigación y perspectivas procedentes del ámbito académico y de la industria.
Compartir una idea con YOHOLIFE® LAB
Enfoque de investigación & molecular pipeline.
Explore cinco áreas interconectadas de nuestro marco de investigación y descubra después las moléculas objetivo: sus estructuras, características y estudios publicados. Las preguntas y las nuevas perspectivas son bienvenidas en todo momento.
Valor potencial para la industria y la sociedad
PURELIX® podría ayudar a investigadores e industria a evaluar nuevas formas de producir compuestos útiles. Su valor residiría en comprender cuándo una vía biológica es técnicamente creíble y dónde puede complementar las fuentes existentes.
Posibilidades de abastecimiento adicionales. Una vía biológica viable podría complementar el cultivo y la extracción de un compuesto claramente definido.
Conocimiento de procesos transferible. Los registros de rutas, enzimas y cultivo podrían ayudar a los equipos a comprender la variabilidad y a diseñar ensayos de desarrollo más informativos.
Decisiones industriales mejor fundamentadas. La evidencia sobre la identidad del producto, la recuperación y el proceso podría revelar qué conceptos merecen más trabajo y qué obstáculos persisten antes del escalado.
Comparación responsable de vías. La evaluación del rendimiento de producción, los recursos utilizados, la energía y los requisitos del procesado posterior podría orientar las decisiones sobre recursos; cualquier ventaja ambiental tendría que demostrarse para el proceso completo.
Cómo una molécula se convierte en una pregunta de producción.
El desarrollo comienza con una identidad molecular definida y una especificación prevista para el material. A continuación, pueden compararse rutas, enzimas y huéspedes biológicos candidatos según criterios medibles: selectividad del producto, repetibilidad, recuperación, pureza y requisitos prácticos del proceso.
PURELIX® conecta estas preguntas en lugar de tratar la conversión biológica como el resultado final. Una vía prometedora también debe superar el escrutinio analítico y la comparación de procesos. A medida que se desarrolle la evidencia, la plataforma puede respaldar decisiones sobre la optimización posterior, el escalado y las eventuales aplicaciones en la investigación de ingredientes y la biofabricación.
Explorar juntos
Damos la bienvenida a colaboradores académicos e industriales con ideas en diseño de rutas, descubrimiento de enzimas, fermentación, caracterización analítica o procesado posterior (downstream). Un método propuesto, un cuello de botella sin resolver o una pregunta específica sobre un compuesto pueden servir de punto de partida.